换一批摘要膜蛋白的类型与其功能是密切相关的,因此膜蛋白类型的预测是研究其功能的重要手段,从蛋白质的氨基酸序列出发对膜蛋白的类型进行预测有重要意义.文章基于蛋白质的氨基酸序列,将组合离散增量和伪氨基酸组分信息共同作为预测参数,采用随机森林分类器,对8类膜蛋白进行了预测.在Jackknife检验下的预测精度为86.3%,独立检验的预测精度为93.8%,取得了好于前人的预测结果.
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关键词
生物膜蛋白随机森林法离散增量离散傅里叶谱伪氨基酸组分Biological membrane proteinRandom forests algorithmIncrement of divemityDiscrete Fourier spectrumPseudo amino acid composition
分类号
Q61（理论生物物理学）
栏目名称
DOI
10.3321/j.issn:1000-6737.2009.05.009
发布时间
2010-01-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家自然科学基金（30960090）
内蒙古自治区自然科学基金（2009MS0111）
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