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基于Progressive多序列比对方法的求解多序列比对的启发式算法

A heuristic algorithm for multiple sequence alignment base on progressive multiple alignment

摘要在生物信息学研究中,生物序列比对问题占有重要的地位.多序列比对问题是一个NPC问题,由于时间和空间的限制不能够求出精确解.文中简要介绍了Feng和Doolittle提出的多序列比对算法的基本思想,并改进了该算法使之具有更好的比对精度.实验结果表明,新算法对解决一般的progressive多序列比对方法中遇到的局部最优问题有较好的效果.

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分类号 TP271+.82
栏目名称
DOI 10.3969/j.issn.1672-5565.2005.04.008
发布时间 2006-01-19(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
基金项目
黑龙江省自然科学基金((F2004-16)) 国家科技攻关项目((2003AA118030))
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生物信息学

生物信息学

2005年3卷4期

171-174页

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