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首页 > 生物信息学 > 基于后缀列的基因序列最大串联重复查找技术

基于后缀列的基因序列最大串联重复查找技术

Technique of locating maximal tandem repeats in genomic sequences based on the suffix array

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摘要重复序列分析在全基因组研究中起着重要作用,其首要任务就是在DNA序列中识别并定位所有的重复结构.本文提出了一种新的算法,此算法基于一种简单的数据结构--后缀数,用于查找给定的DNA序列中所有的最大串联重复.并且在该算法的基础上编写了一个有效实用的软件--RepLocate,同时给出了它应用到已知的DNA序列的实例.

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作者 王晓敏 [1] 王正志 [1] 学术成果认领
作者单位 国防科技大学自动控制系,长沙,410073 [1]
关键词 最大串联重复后缀阵基因组序列maximal tandem repeatssuffix arraygenomic sequences
医学主题词 基因组(Genome)基因(Genes)算法(Algorithms)序列分析(Sequence Analysis)研究(Research)
分类号 TP311
栏目名称
技术与方法
DOI 10.3969/j.issn.1672-5565.2006.02.007
发布时间 2006-07-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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生物信息学

生物信息学

2006年4卷2期

72-75页

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