换一批Tup1突变对转录抑制局部网络中基因表达的非线性影响
Nonlinear responses in a transcriptional repression local gene network induced by Tup1 gene mutations
摘要研究基因网络的非线性行为特征是研制基因网络技术的基础.Tup1基因是酵母中作用最为广泛的转录抑制因子之一,利用酵母生物信息学数据库中蛋白相互作用关系,构建一个以Tup1为中心,4个层次741个基因的局部基因网络.统计分析六张Tup1不同突变的基因表达芯片数据,将局部基因网络中的全部基因按照3个网络特征进行统计分析:必需\非必需基因、网络层次和网络节点,并研究这些特征与基因表达之间的关系.初步发现基因表达变化的强度与节点数目成一定的反比关系,必需基因的平均变化程度较非必需基因为低,且由Tup1突变引发的其他基因的表达变化在以Tup1为中心的局部基因网络中近层次网络变化程度较大,远层次网络变化程度较低.
更多相关知识
分类号
Q754（分子遗传学）
DOI
10.3969/j.issn.1672-5565.2009.04.009
发布时间
2010-02-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
新世纪优秀人才支持计划（2006;30570401）
- 浏览162
- 被引3
- 下载0
相似文献
- 中文期刊
- 外文期刊
- 学位论文
- 会议论文
