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肠道病毒71型基因组中小干扰RNA的靶位点预测

Prediction for Target Sites of Small Interfering RNA Duplexes in Enterovirus 71

摘要肠道病毒71型(EV71)已经在世界范围内有过十多次大的爆发与流行,近年来EV71病毒的流行在亚洲逐渐呈上升的趋势,但是目前尚无有效的治疗措施,因此迫切需要一种治疗EV71的有效药物.本文采用生物信息学的方法,对人类EV71病毒三个不同株型 (SHZH03, SHZH98和MS) RNA序列的局域二级结构进行了预测,并从这些病毒株的基因组中分别得到了长度在21~25nt的小干扰RNA靶序列碱基片段.这一结果将有助于治疗EV71药物的开发研究,对预防和控制EV71的爆发和流行也会有重要意义.

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生物信息学

生物信息学

2009年7卷4期

292-294,299页

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