换一批苏云金芽孢杆菌Ⅳ型抗癌晶体蛋白的分子模建
Structural characterization of cancer cell-killing crystal protein Parasporin-4 from Bacillus thuringiensis
摘要通过同源建模得到了抗癌晶体蛋白Parasporin-4的初始三维结构,利用分子动力学的方法对初始三维结构进行优化,同时分析了模建分子的结构,最后利用Ramachandran plot,结构匹配等方法对模型进行评价.结果显示得到的Parasporin-4结构是具有三个结构域,蛋白模型分子中的键长、键角以及二面角的分布合理,与模版蛋白的主链α碳原子的均方根差RMSD值为0.547 742,在合理范围之内,表明Parasporin-4蛋白模型良好.研究结果为抗癌晶体蛋白的抗癌的分子机制及其定向改造提供了结构信息.
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关键词
抗癌晶体蛋白空间结构同源建模分子动力学模拟parasporin-4three dimensional structureshomology modelingMolecular Dynamics Simulation
医学主题词
蛋白(Egg White)癌(Carcinoma)晶体(Lens, Crystalline)苏云金芽孢杆菌(Bacillus thuringiensis)分子动力学模拟(Molecular Dynamics Simulation)
DOI
10.3969/j.issn.1672-5565.2009.04.020
发布时间
2010-02-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家自然科学基金（40601046）
福建省高等学校新世纪优秀人才支持计划
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