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基于多分类支持向量机的基因表达系列分析

Analysis of SAGE data using multi class classification and support vector machine

摘要基因表达系列分析(Serial analysis of gene expression,SAGE)是一种基因表达数据,反映了细胞内的动态变化.模式识别和可视化方法是分析SAGE数据的基本工具,但是由于缺乏描述数据的统计特性,传统的聚类分析技术不适用于SAGE数据的分析.本文提出了一种基于多分类和支持向量机的SAGE数据的分析法.经过对模拟数据和人类癌症SAGE数据的分析,基于径向基核函数的多分类支持向量机算法"一对一"(one-against-one,OAO)算法提供了比PoissonC和PoissonS更好的分类结果.

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生物信息学

生物信息学

2010年08卷4期

356-358,363页

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