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首页 > 生物信息学 > 水稻SBP基因家族的生物信息学分析

水稻SBP基因家族的生物信息学分析

Bioinformatics analysis of SBP-box gene family in rice

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摘要SQUAMOSA PROMOTER BINDING PROTEIN–LIKE (SBP) 转录因子家族是植物特有的一类转录因子.本文确定了20水稻基因组上编码的SBP基因.通过分类,染色体定位,保守区确定,亲缘关系,以及水稻SBP家族中的重复基因及该家族成员形成蛋白二聚体的可能性进行分析,其次利用了Affymetrix水稻基因组芯片数据,对所有这些基因的表达谱进行了分析.结果表明,水稻SBP基因在花和种子的发育过程中可能发挥重要作用,而其对环境胁迫却不敏感.这对进一步研究SBP的功能提供了有价值的线索和思路.

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作者 王翊 [1] 胡宗利 [1] 杨妤欣 [1] 陈绪清 [2] 陈国平 [1] 学术成果认领
作者单位 重庆大学,生物工程学院,重庆,400044 [1] 北京市农林科学院北京农业生物技术研究中心,北京,100089 [2]
关键词 SBP-box水稻基因芯片表达谱SBP-boxricemicroarrayexpression profiling
医学主题词 稻属(Oryza)基因(Genes)计算生物学(Computational Biology)转录因子(Transcription Factors)基因组(Genome)
分类号 Q518.2（蛋白质）
DOI 10.3969/j.issn.1672-5565.2011.01.020
发布时间 2011-05-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家自然科学基金（30771463,31000911） 重庆市科技攻关计划（CSTC,2009AB5174）
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生物信息学

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2011年09卷1期

82-87,92页

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