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绿色木霉内切几丁质酶cDNA的克隆及其编码蛋白的序列分析

cDNA cloning of the endochitinase from Trichoderma viride and the sequence analysis of its encoding protein

摘要根据已克隆的内切几丁质酶基因序列的同源性比较,设计引物,采用PCR技术从绿色木霉基因组中分离出一个大小为1467bp的特异DNA片段,采用RT-PCR技术从绿色木霉总RNA中分离出大小约1 276bp的cDNA片段.序列对比后发现该内切几丁质酶DNA含有三个内含子,大小分别为52bp,69bp,64bp.同源性分析表明其全长cDNA序列和已经报道的内切几丁质酶序列的同源性高达95%以上,预测其编码蛋白的氨基酸序列含424个氨基酸残基,分子量为46 kDa,氨基酸序列分析表明该内切几丁质酶164-172位氨基酸是其活性中心,用同源建模法模拟其空间结构模型,为进一步研究其作用机制奠定了良好基础.

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DOI 10.3969/j.issn.1672-5565.2013.02.
发布时间 2013-10-10(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
基金项目
浙江省自然科学基金((M303087)) 浙江省科学技术厅项目((2006C23073)) 杭州市科技局项目((20061133B26))
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