基于核小体位置预测的酵母进化印迹研究
Study of yeast evolutionary footprints based on the prediction of nucleosome positioning
摘要在利用核小体定位实验数据训练支持向量机(SVM)对任意酵母DNA序列的核小体形成能力进行预测的过程中,发现染色质结构对基因组DNA分子进化过程有着显著影响.我们观察到核小体DNA比连接DNA的平均预测准确率低15%,这种普遍存在的局部预测准确率差异性代表了酵母核小体定位的进化印迹(Evolutionary footprint),它揭示了核小体组织在基因组的整个进化过程中所具有的保守性.
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关键词
核小体转录起始位点预测准确率进化印记NucleosomeTranscriptional Start SitPredictive Accuracy RatesEvolutionary Footprints
分类号
Q-3
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1672-5565.2013.14.
发布时间
2013-10-10
基金项目
国家自然科学基金资助项目(31160234);
云南省应用基础研究计划项目(2011FB082)
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