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比较图元向量和点的聚类系数对差异网络的研究

Comparing graphlet orbit and clustering coefficient in differentially network

摘要差异分析对于揭示生命体的生长、发育和衰老过程及疾病发生具有重大的意义,基于网络的差异分析方法已经成为系统生物学的一个研究热点.网络节点往往通过与局部结构作用实现某种功能,其与局部结构的关系变化,很可能影响其功能.本文利用仿真实验的方法比较了图元向量和点的聚类系数两种局部结构测度的性能,并且利用他们分别设计算法挖掘差异网络中模块化变化的基因簇.应用AGEMAP数据库中小鼠12个组织基因表达数据进行实验,大部分聚类簇都高度显著富集与衰老相关的GO项.

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DOI 10.3969/j.issn.1672-5565.2013.04.04
发布时间 2014-02-14(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
基金项目
国家自然科学基金((61272018, 60970065, 61174162,)) 浙江省自然科学基金((R1110261,Y1080227,)) 浙江省新苗人才计划项目((2012R424051))
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