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拟南芥GA2ox基因家族启动子分析

Promoter analysis of GA2ox gene family in Arabidopsis thaliana

摘要赤霉素是一类重要的植物激素,它参与调节植物生长发育的各个阶段.真核基因的表达受多种因素的调控,其中启动子在转录水平上的调节作用至关重要,但是目前对拟南芥GA2ox基因家族上游顺式元件的详细分析较少.本研究分析了AtGA2ox基因家族染色体定位、进化关系、蛋白模体以及顺式元件.分析结果表明:AtGA2ox基因家族分为2个亚类;具有相对集中的染色体分布;具有相似的内含子和外显子结构;AtGA2ox基因家族成员进化关系越相近,模体和顺式元件则越保守且分布位置更接近.PLACE和Plant CARE以及DMB分析显示,AtGA2ox基因家族存在许多保守元件,受多因素的调控,在此家族的上游调控区域普遍存在组织和器官特异性表达元件、光响应元件、激素响应元件以及其他环境响应元件.基因表达谱分析结果表明,在激素诱导下,AtGA2ox基因家族均有响应.这些元件不仅作为正调控元件,诱导部分AtGA2ox基因的表达,而且还能作为负调控元件,抑制其他AtGA2ox基因的表达.

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