换一批利用伪氨基酸组分和支持向量机预测抗冻蛋白
Predicting antifreeze proteins by using pseudo amino acid composition and support vector machine
摘要抗冻蛋白是一类具有提高生物抗冻能力的蛋白质.抗冻蛋白能够特异性的与冰晶相结合,进而阻止体液内冰核的形成与生长.因此,对抗冻蛋白的生物信息学研究对生物工程发展,提高作物抗冻性有重要的推动作用.本文采用由400条抗冻蛋白序列和400条非抗冻蛋白序列构成数据集,以伪氨基酸组分为特征,利用支持向量机分类算法预测抗冻蛋白,对训练集预测精度达到91.3％,对测试集预测精度达到78.8％.该结果证明伪氨基酸组分能够很好的反映抗冻蛋白特性,并能够用于预测抗冻蛋白.
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医学主题词
抗冻蛋白质类(Antifreeze Proteins)支持向量机(Support Vector Machine)预测(Forecasting)蛋白(Egg White)才能(Aptitude)
分类号
Q753（分子遗传学）
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1672-5565.2013.04.10
发布时间
2014-02-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
内蒙古科技大学青年创新基金（(2011NCL048)）
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