换一批
换一批高通量DNA甲基化数据的处理和分析方法
Methods of bioinformatics analysis for high-throughput sequencing of DNA methylation
摘要DNA甲基化作为一种表观遗传学修饰,在调控基因表达、X染色体失活、印记基因等方面都发挥着重要的作用.不同的DNA甲基化的预处理方法结合二代测序产生了大量的高通量甲基化数据,这些数据的存储、处理和分析是当前亟需解决的问题.在本文中,总结了目前存在的三种高通量DNA甲基化检测技术(限制性内切酶法,亲和纯化法,重亚硫酸盐转换法),以及针对这些技术产生的高通量数据开发的存储、处理和分析工具.另外,还注重介绍了单碱基水平的DNA甲基化检测技术,BS-Seq的测序原理、数据处理流程以及后续的分析工具.
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分类号
N37
栏目名称
研究快报
DOI
10.3969/j.issn.1672-5565.2014.01.12
发布时间
2014-05-13
基金项目
黑龙江省大学生创新创业训练计划
国家自然基金青年项目
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