换一批
换一批基于氨基酸约化和统计特征的蛋白质亚细胞定位预测
Protein subcellular localization prediction based on reduced representation of amino acid and statistical characteristic
摘要蛋白质亚细胞定位预测对蛋白质的功能、相互作用及调控机制的研究具有重要意义。本文基于物化性质和结构性质对氨基酸的约化，描述序列局部和全局信息的“组成”、“转换”和“分布”特征，并利用氨基酸亲疏水性的数值统计特征，提出了一种新的蛋白质特征表示方法（ NSBH）。分别使用三种分类器KNN、SVM及BP神经网络进行蛋白质亚细胞定位预测，比较了几种方法和特征融合方法的预测结果，显示融合特征表示及结合SVM分类器时能够达到更好的预测准确率。同时，还详细讨论了不同参数对实验结果的影响，具体的实验及比较结果显示了该方法的有效性。
更多相关知识
关键词
蛋白质亚细胞定位氨基酸物化性质支持向量机Subcellular localizationPhysicochemical propertiesSupport vector machine ( SVM)
分类号
Q811
栏目名称
研究论文
DOI
10.3969/j.issn.1672-5565.2015.02.05
发布时间
2015-07-24
- 浏览88
- 被引6
- 下载12
相似文献
- 中文期刊
- 外文期刊
- 学位论文
- 会议论文
