换一批
换一批ABIPGM测序平台用于细菌基因组denovo测序的评价
Evaluation of PGM sequencing platform using in bacterial genome de novo sequencing
摘要为了探索加快细菌基因组研究的方法，利用ABI PGM测序平台测定了1株单细胞硫还原地杆菌的基因组序列。测序共获得1．4 Gbp 数据，平均读长为177 bp。通过多个拼接软件并采用合适的组装策略，得到一个完整细菌基因组3．55 Mbp和一条完整质粒序列110 kbp。测定基因组序列与参考基因组kn400序列的相似性达到94％，参考基因组91％的基因能在测定基因组中找到相似基因。通过本研究表明采用ABI PGM测序平台结合灵活的拼接策略可快速构建细菌基因组精细图谱，为进一步的功能注释及深入的信息分析提供准确的数据，大大加快研究进程。
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