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Ydj1p锌指结构突变体对底物结合影响的分子动力学模拟分析

Using molecular dynamics tostudy the effects of Zinc mutant of Ydj1p to the binding of substrate

摘要Ydj1p是酵母细胞质中一种主要的Ⅰ型Hsp40分子伴侣,Ydj1p锌指结构在传递底物给Hsp70时发挥重要的作用,锌指结构域的两个锌离子结合位点区域(ZBD Ⅰ和ZBDⅡ)与半胱氨酸形成配位键对底物传递中维持结构稳定非常重要.本研究通过分子动力学手段对Ydj1p与各锌指结构突变体进行了模拟,分析ZBD Ⅰ突变体关键残基C143S、C201S,ZBDⅡ突变体关键残基C162S、C185S的突变影响Hsp40与Hsp70的底物传递.分析结果表明,当锌指部位的氨基酸发生突变,不仅能影响Ydj1p的结构稳定性,也能影响底物的传递,并且锌指结构Ⅰ突变体和锌指结构Ⅱ突变体之间也具有明显差异.通过结合能量的分析以及构象变化比对,揭示了Ydj1p以及各锌指结构突变体底物结合能力的强弱,这与生化实验研究了Ydj1p锌指结构与Hsp70合作,帮助多肽传递的功能是至关重要的结果较为相近.

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