换一批摘要本文在菱形网格上研究讨论了二维HP模型.首先,将蛋白质结构预测问题转化成一个数学问题,并简化成氨基酸序列中每个氨基酸与网格格点的匹配问题.为了解决这个数学问题,我们改进并扩展了经典的粒子群算法.为了验证算法和模型的有效性,我们对一些典型的算例进行数值模拟.通过与方格网上得到的蛋白质构象进行比较,菱形网上的蛋白质构象更自然,更接近真实.我们进一步比较了菱形网格上的紧致构象和非紧致构象.结果显示我们的模型和算法在菱形网格上预测氨基酸序列的蛋白质结构是有效的有意义的.
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关键词
蛋白质结构预测最优化模型粒子群算法调整策略Protein structure predictionOptimization modelParticle swarm algorithmAdjustment strategy
分类号
Q517（蛋白质）
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1672-5565.20160702001
发布时间
2017-09-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家自然科学基金（11601288）
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