摘要纳米抗体是骆驼科动物中发现的抗体的一个亚类,是由单个多肽链组成的多功能分子结合支架.纳米抗体优越的性能决定了其在生物医学、食品科学等领域的广泛应用.尽管纳米抗体序列和结构数据已十分庞大,但其来源的异质性和缺乏标准化阻碍了纳米抗体信息的可靠收集.为了有效整合当前已公开的纳米抗体的庞大数据,有必要建立用于免疫信息学的纳米抗体数据库.提出了一个纳米抗体结构数据库系统NANO(http://124.221.201.63:8000/index).该系统收集和存储了 2 160 条纳米抗体的序列和结构信息,提供文本、序列、氨基酸分区等基本搜索以及物种,亲和力和序列长度等高级搜索功能.与INDI,PDB,NCBI,SAbDab-nano等现有数据库系统的比对实验表明,NANO系统在检索字段,检索功能覆盖和检索时间性能方面均表现出色.可应用于筛选或设计高亲和力的纳米抗体,促进新型纳米抗体特异性计算方案的开发.
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