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黄酮3-羟化酶(F3H)的生物信息学分析

Bioinformatics analysis of flavanone-3-hydroxylase( F3H)

摘要通过生物信息学分析方法,对已经在GenBank上注册的青稞( Hordeum vulgare)、高粱( Sorghum bicolor)、小麦( Triticum aestivum)、玉米( Zea mays)、洋葱( Allium cepa)、花烛( Anthurium andraeanum)和美丽百合( Lilium specio-sum)等7种单子叶植物的F3H核酸以及相应氨基酸序列进行研究,并对其组成成分、理化性质、信号肽、亚细胞定位、跨膜结构、蛋白质二级、三级结构、结构域以及分子进化等方面进行分析与预测. 研究结果表明,除玉米F3 H蛋白定位于过氧化物酶体外,其他植物F3 H均定位于细胞质基质内;所有植物F3 H均为不含信号肽的非分泌型蛋白,且没有跨膜区域的亲水性蛋白;α-螺旋和无规则卷曲是F3 H的主要二级结构元件,而延伸链则散布于整个蛋白中;F3H拥有一个2OG-Fell Oxy super family和一个PLNO3176 super family保守结构域;所构建的F3H系统发育进化关系与形态学上物种发育关系基本吻合.

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栏目名称
DOI 10.3969/j.issn.2095-1736.2015.06.025
发布时间 2016-01-22(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
基金项目
国家自然科学基金(31170916)
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生物学杂志

生物学杂志

2015年32卷6期

25-29页

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