鲤疱疹病毒3型焦磷酸测序检测方法的建立

Development of pyrosequencing assay for detection of Cyprinid herpesvirus 3

二维码有效期 120s

摘要为了针对鲤疱疹病毒3型(Cyprinid herpesvirus 3,CyHV-3)建立一种基于焦磷酸测序技术的高通量、自动化、快速的检测方法,根据CyHV-3 ORF55、ORF79和ORF92基因保守区域设计特异性PCR扩增引物和测序引物,进行PCR扩增筛选扩增效率最高的引物.PCR灵敏性和特异性试验结果显示,针对ORF79设计的引物扩增效率最高,最低检测量为100个拷贝数,且能特异性识别CyHV-3;将PCR产物进行焦磷酸测序,获得的序列经BLAST比对显示与CyHV-3-U、I、J和GZ11分离株一致性均为100%.该检测方法方便快速,适用于出入境口岸大批量样品CyHV-3诊断检测.

作者郑树城 ^[1] 王庆 ^[2] 李莹莹 ^[2] 曾伟伟 ^[2] 王英英 ^[2] 刘春 ^[2] 石存斌 ^[2] 学术成果认领

作者单位中国水产科学研究院珠江水产研究所农业部渔药创制重点实验室广东省水产动物免疫技术重点实验室, 广州 510380;上海海洋大学水产与生命学院, 上海 201306 ^[1] 中国水产科学研究院珠江水产研究所农业部渔药创制重点实验室广东省水产动物免疫技术重点实验室,广州,510380 ^[2]

关键词鲤疱疹病毒3型锦鲤疱疹病毒焦磷酸测序检测 Cyprinid herpesvirus 3 (CyHV-3)koi herpesvirus (KHV)pyrosequencing detection

主题词病毒(Viruses)鲤鱼类(Carps)方法(Methods)敏感性与特异性(Sensitivity and Specificity)效率(Efficiency)

分类号 Q78

栏目名称 技术方法

DOI 10.3969/j.issn.2095-1736.2017.03.095

发布时间 2017-06-30

基金项目

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