换一批杭州湾入海口沉积物原核生物多样性分析
Prokaryotic community diversity in the estuarine sediments of Hangzhou Bay, China
摘要为了解杭州湾入海口沉积物中原核生物多样性特征及其与环境因子的关系,应用Illumina Miseq测序平台对原核微生物16S rRNA基因V3-V4区序列进行了高通量测序,分析了杭州湾入海口13个点位的沉积物原核生物多样性特征.结果表明:1)共有原核生物65个门、210个纲、419个目、688个科和1118个属,Shannon-Wiener指数平均值达9.72;主要优势菌有变形菌(Proteobacteria)、绿弯菌(Choloroflexi)和拟杆菌(Bacteroidetes)等,其中变形菌相对丰度最大;2)杭州湾南岸沉积物中厚壁菌(Firmicutes)的丰度比北岸高,对比上虞工业区和金山工业区排污口的样品可以发现,前者β变形菌相对丰度较高,而后者γ变形菌的相对丰度较高;3)绿菌(Chlorobi)、放线菌(Acti-nobacteria)、拟杆菌和β变形菌(β-Proteobacteria)等相对丰度与总有机碳(TOC)显著相关;拟杆菌、放线菌和酸杆菌(Acidobacteria)等相对丰度与pH值显著相关;Fe和As皆与α变形菌、GN04和绿菌丰度具有显著相关性,Mn和Cu也分别与GN04和螺旋体(Spirochaetes)显著相关.因此,应用高通量测序方法可用于杭州湾入海口原核生物群落多样性特征分析,进而了解该区域原核生物分布与环境之间的相关关系.
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关键词
沉积物原核生物多样性16S rRNA基因高通量测序杭州湾入海口sedimentprokaryotic diversity16S rRNA genehigh-throughput sequencingEstuary of Hangzhou Bay
分类号
Q938
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.2095-1736.2018.03.047
发布时间
2018-07-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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