换一批
换一批西藏拟溞Daphniopsis tibetana核糖体18 S和ITS2序列克隆及进化分析
Cloning and phylogenetic analysis ribosomal 18 S and ITS2 sequences in Daphniopsis tibetana Sars
摘要利用PCR反应扩增出西藏拟溞Daphniopsis tibetana核糖体18S和转录间隔区II(ITS2)片段,经克隆测序后获得其序列,在此基础上研究西藏拟溞分类进化地位.西藏拟溞18S rDNA序列长2296 bp,A、T(U)、G、C含量分别为21.2％、24.4％、29.8％和24.6％;ITS2序列长度平均为1229 bp,A、T(U)、G、C含量平均为28.3％、23.5％、25.5％及22.7％.采用最大似然法(ML)构建的18S rDNA系统进化树显示,西藏拟溞D.tibetana和方角拟溞D.quadrangula亲缘关系最近,在进化树上聚集在同一分支;和溞属的大型溞Daphnia magna在不同分支上,该结果再次证明了西藏拟溞在分类上应归属于拟溞属.与18S rDNA相比,西藏拟溞ITS2序列存在个体间碱基及长度差异,与同科异属物种之间差异更大.获得的西藏拟溞18S rDNA、ITS2序列,为该种进一步的分子水平研究提供了基础数据.
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