基于线粒体COⅡ基因和D-loop区序列对江西安南光唇鱼(Acrossocheilus)物种鉴定及系统发育位置分析
Species identification and phylogenetic position of Acrossocheilus fasciatus from Annan in Jiangxi Province based on mitochondrial COⅡ and D-loop region sequences
摘要以采自江西赣州安南的野生鱼为实验材料,分别设计引物扩增其线粒体DNA COⅡ和D-loop序列并进行序列比对分析,经扩增得到的COⅡ序列全长为691 bp,D-loop序列的全长为937~944 bp,其中COⅡ序列中A、T、G、C的平均占比分别为31.00% 、25.80% 、15.30% 和27.90%,而D-loop序列的占比则分别为35.60% 、32.30% 、12.00% 和20.00%,两序列都是A+T含量高于G+C,G的含量在4种碱基中最低.COⅡ序列中仅存在6个碱基位点的转换,D-loop则有多个碱基位点存在转换、颠换、缺失或插入,群体内遗传距离分别为0.0075、0.0050.用最大似然法构建的COⅡ和D-loop系统发育树显示赣州安南光唇鱼与半刺光唇鱼(Acrossocheilus hemispinus)亲缘性最近,序列相似性分别为98.70% 、98.69%,遗传距离最近分别为0.0130、0.0260,未达到种间分化的水平(0.05).2个序列分析结果一致,结合外部形态特征观察,可以断定赣州安南光唇鱼与半刺光唇鱼为同一种,研究为江西赣州安南光唇鱼的资源利用提供了资料.
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