火炬松HMGR基因的系统发育、分子进化和表达分析
Phylogenetic, molecular evolution and expression analyses of HMGR gene in loblolly pine
摘要3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(HMGR)是植物萜类化合物甲羟戊酸(MVA)生物合成途径的关键酶.为了解其编码基因HMGR的系统发育及其在火炬松进化枝中的分子进化和表达特性.选取19个代表性物种的HMGR基因序列用于系统发育和分子进化分析,并以火炬松5个不同的组织部位为材料分析HMGR基因的表达特性.结果发现:HMGR基因在进化过程中相对保守,序列间的平均遗传距离为0.323,受到的平均选择压大小为0.1212,表明HMGR基因在进化过程主要受纯化选择作用;在火炬松进化枝中受到的选择压大小为0.4293,并有14个位点检测到正向选择作用,且后验概率值大于0.95,表明HMGR基因不同位点受到的选择压差异显著;HMGR基因在火炬松嫩叶中具有最高的表达量,表明HMGR基因的表达具有一定的组织特异性.
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