基于转录组测序的兔儿伞羽扇豆醇合成途径及关键酶基因研究

Identification of key enzyme genes involved in lupeol synthesis pathway in Syneilesis aconitifolia by transcriptome analysis

二维码有效期 120s

摘要为解析兔儿伞羽扇豆醇生物合成途径,探究其关键酶基因,研究运用DNBSEQ测序平台对兔儿伞的叶、茎、根及根茎进行转录组测序,从头组装后获得了 191541条Unigenes.KEGG代谢通路分析表明有961条Unigenes涉及兔儿伞羽扇豆醇生物合成途径,其中,395条Unigenes编码羽扇豆醇生物合成途径的17个关键酶.根与其他各组织比较,24条共有差异表达基因涉及羽扇豆醇生物合成途径,编码了法尼基焦磷酸合酶(farnesyl diphosphate synthase,FPPS)、角鲨烯合成酶(squalene synthase,SS)、角鲨烯环氧酶(squalene epoxidase,SE)等关键酶.对关键酶FPPS、SS和SE进行结构分析,发现它们均具有保守的催化结构域和底物结合结构域.研究丰富了兔儿伞植物的功能基因数据库,为进一步研究羽扇豆醇生物合成途径及其关键酶基因的功能和调控机制奠定了基础.

作者张京晶 ^[1] 许景垚 ^[1] 单婷玉 ^[1] 赵历强 ^[1] 钟欣欣 ^[1] 张帅帅 ^[1] 吴家文 ^[2] 学术成果认领

作者单位安徽中医药大学研究生院,合肥 230012;安徽中医药大学科研技术中心新安医学教育部重点实验室,合肥 230038 ^[1] 安徽中医药大学科研技术中心新安医学教育部重点实验室,合肥 230038;安徽省中医药科学院,合肥 230012;安徽道地中药材品质提升协同创新中心,合肥 230012 ^[2]

关键词兔儿伞转录组测序羽扇豆醇法尼基焦磷酸合酶角鲨烯合成酶角鲨烯环氧酶 Syneilesis aconitifolia transcriptome sequencing lupeol farnesyl diphosphate synthase squalene synthase squalene epoxidase

分类号 Q344+.13 Q78 S567.239

栏目名称 研究报告

DOI 10.3969/j.issn.2095-1736.2024.01.032

发布时间 2024-03-20

基金项目

国家重点研发计划 安徽省自然科学基金 安徽省高等学校科学研究项目