换一批摘要为探索环境水样中鱼类DNA的最佳保存方法和保存时间,选取饲养鱼的水样为研究对象,在无核酸污染的环境中,采用 0.45 μm孔径滤膜对相同体积的水样进行预处理,并对富集环境DNA(eDNA)的滤膜进行不同保存方法和不同保存时间捕获的eDNA质量、鱼类 12S rRNA 基因文库浓度、基于ASVs方法的鱼类 12S rRNA 扩增子测序结果的比较研究.研究结果显示:-20℃冷冻、-80℃冷冻、无水乙醇-常温、75%乙醇-常温、Longmire's保存液-常温以及TK保存液-常温等6种保存方法捕获的eDNA效果最好的是TK保存液-常温,其次为冷冻保存(-20℃、-80℃).-20℃冷冻、-80℃冷冻和TK保存液-常温等 3 种保存方法在同一保存时间下具有良好的稳定性,且在保存时间 2周内的测试条件下,也能稳定保存滤膜,最大程度还原水样中鱼类的遗传信息.研究对eDNA样本最佳保存条件的探索,将为第三方基因检测实验室对鱼类eDNA保存策略提供技术基础,便于eDNA宏条形码技术的开展.
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关键词
eDNA保存条件DNA提取扩增子测序ASVs方法environmental DNApreservation conditionsDNA extractionamplicon sequencingavailable amplicon sequence variant method
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.2095-1736.2024.03.114
发布时间
2024-06-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家重点研发计划（2022YFE0128600）
杭州市农业与社会发展科研引导项目（20220919Y182）
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