换一批
换一批假单胞菌1616X1的产酸特性及其全基因组测序分析
Acid production characteristics and complete genome sequencing analysis of Pseudomonas sp.1616X1
摘要为探究假单胞菌溶解难溶性无机磷的作用机理,以高效溶磷假单胞菌 1616X1 为对象,以Ca3(PO4)2 为磷源,高效液相色谱法测定菌株溶磷过程中的有机酸种类及含量变化,通过Illumina HiSeq X Ten测序平台对假单胞菌 1616X1 全基因组进行测序,序列拼装后完成基因预测、功能注释和溶磷相关基因分析.结果表明,假单胞菌1616X1 在溶磷过程中产生葡萄糖酸、酒石酸与柠檬酸等多种有机酸,其中,以葡萄糖酸为主,在溶磷量最高时葡萄糖酸含量达 17582.06 mg/L;全基因组测序及分析结果表明,菌株 1616X1 基因组长度 5957620 bp,GC 含量61.55%,含有 5535 个编码基因.经COG、GO和KEGG数据库比对和注释,其中,含有吡咯喹啉醌生物合成基因簇(pqq)、磷酸盐转运系统合成基因(pst与pit)、磷饥饿反应调控基因(phoB、phoR与phoH)以及葡萄糖脱氢酶基因(gdh)、吡咯喹啉醌依赖性葡萄糖脱氢酶基因(gcd)、柠檬酸合酶基因(gltA)与酒石酸脱氢酶基因(ttuC)等有机酸合成基因.研究为假单胞菌 1616X1 溶磷作用规律的阐释和基因改造等后期研究开发奠定基础.
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关键词
假单胞菌土壤溶磷有机酸基因组分析溶磷基因Pseudomonassoil phosphorus solutionorganic acidsgenome analysisphosphate solubilizing genes
分类号
Q75
栏目名称
研究报告
DOI
10.3969/j.issn.2095-1736.2025.01.036
发布时间
2025-02-25
基金项目
河南工业大学创新基金支持计划
国家自然科学基金
郑州市R&D专项经费补助科研项目
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