换一批基于二叉树支持向量机的蛋白质结构类预测
Protein Structural Class Prediction with Binary Tree-Based Support Vector Machines
摘要提出了一种基于二叉树支持向量机(BT-SVM)的蛋白质结构类多类预测新方法.采用26维的向量来表示蛋白质序列的特征.BT-SVM多类分类方法能消除SVM在多分类问题中存在的不可分数据问题.采用两个经典数据集作为测试数据,通过自身一致性和n折叠交叉验证方法测试了新方法的性能.预测结果表明新方法具有良好的预测能力,与使用同一数据集的已有结果相比较,新方法的Jackknife结果和目前最好的方法取得的结果相当,可作为蛋白质结构类预测的一个工具.
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分类号
Q518.1（蛋白质）TP391
栏目名称
DOI
10.3321/j.issn:1001-5515.2008.04.038
发布时间
2008-10-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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