换一批基于TCGA及Oncomine数据库挖掘TMEM164在肝细胞癌中的表达及临床意义
Expression and clinical significance of TMEM164 in hepatocellular carcinoma based on data-mining of TCGA and Oncomine databases
摘要目的 TMEM164是TMEM家族的一员,实验基于肿瘤基因组图谱(TCGA)和Oncomine数据库评估了 TMEM164在肝细胞癌中表达及临床意义.方法 从GDC Data Portal网站(https://portal.gdc.cancer.gov/)下载424例HCC的RNA表达谱和临床病理参数资料.其中肝细胞癌(HCC)组织374例,癌旁正常组织50例.借助Oncomine数据库进一步扩大样本量,验证TCGA数据库分析结果是否正确.采用Kaplan-Meier曲线和Cox回归分析TMEM164表达与患者预后的相关性,并进行基因集富集分析(GSEA),探讨其潜在作用机制.结果 TMEM164在HCC组织中表达量显著高于癌旁正常组织(P＜0.001);TMEM164表达水平与HCC患者的Stage分期和T分期均显著相关(P＜0.05);生存分析显示TMEM164高表达患者总生存率显著低于低表达患者(P＜0.01);单因素及多因素Cox回归分析结果表明TMEM164高表达可能作为HCC患者预后的独立指标.GSEA表明TMEM164可能通过调控mTOR、ERBB等通路进而调控细胞周期、凋亡、自噬及RNA降解等参与HCC的进程,此外TMEM164还可能作用于与免疫相关的信号通路.结论 TMEM164在肝细胞癌中高表达.与患者预后不良相关,可能成为HCC患者的预后标志物及潜在治疗靶点.
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