氧化应激相关基因预测急性ST段抬高型心肌梗死患者心源性死亡
Oxidative stress-related genes predict cardiogenic death in patients with acute ST elevation myocardial infarction
摘要目的 对接受直接经皮冠状动脉介入治疗的急性ST段抬高型心肌梗死(STEMI)患者构建基于差异表达的氧化应激相关基因(DEOSRGs)的生存预测模型.方法 从基因表达综合(GEO)数据库检索并筛选符合选择、排除标准的外周血mRNA表达谱数据集.使用关键词"急性心肌梗死"和"急性冠状动脉综合征",并限定物种为"人".使用GE02R工具鉴定DEOSRGs;使用最小绝对收缩和选择算子惩罚的Cox比例风险回归建立最优模型;使用风险因子分布图、Kaplan-Meier 生存分析和受试者工作特性曲线评估其临床预测价值.结果 选择样本量较小的数据集GSE60993和GSE61144数据集作为训练集,具有完整预后信息的GSE49925数据集用于模型构建和预测价值的验证.通过与氧化应激相关基因集取交集,筛选出10个DEOSRGs,包括9个上调和1个下调的基因.上调基因分别为基质金属蛋白酶9基因(MMP9)、精氨酸酶1基因(ARG1)、FBJ鼠骨肉瘤病毒癌基因同源物基因(FOS)、血管非炎性分子1基因(VNN1)、Toll样受体4基因(TLR4)、白细胞介素18受体辅助蛋白基因(IL18RAP)、中性粒细胞胞质因子1基因(NCF1);花生四烯酸5-脂氧合酶基因(ALOX5)、髓系细胞白血病1基因(MCL1).下调基因为解偶联蛋白2基因(UCP2).MMP9和UCP2是STEMI患者早期阶段最高上调和下调的DEOSRGs.构建的预后模型(风险得分)为(年龄× 0.31)+(Gensini评分× 0.02)+(血清肌酐 × 1.1)+(MMP9表达水平 × 2.52)+[ARG1 表达水平 ×(-0.22)]+[IL18RAP表达水平 ×(-0.51)]-44.3.风险因子分布图、Kaplan-Meier生存曲线分析和受试者工作特性曲线分析显示该模型可有效预测STEMI患者发病2年内的心源性死亡事件.曲线下面积(AUC)分别为0.846、0.816.结论 实验研究对STEMI患者构建了基于DEOSRGs的预后预测模型,可对发病2年内的心源性死亡风险进行有效分层.
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