换一批2023～2024年河北省秦皇岛市新冠病毒基因组变异监测分析
Surveillance and Analysis of SARS-CoV-2 Genomic Variations in Qinhuangdao City,Hebei Province,2023～2024
摘要目的 实时监测河北省秦皇岛市新冠病毒变异株流行趋势和变化特征,掌握各亚型基因组变异特征,为制定本土防控政策提供依据.方法 收集河北省秦皇岛市2023年10月～2024年9月本土新冠病毒感染患者鼻咽拭子样本,共296例,采用二代测序技术进行新冠病毒全基因组测序和分析.结果 经过Pangolin分型分析,2023年第四季度主要流行变异株为HK.3,占比63%,EG.5系列占比37%;2024年第一季度主要流行变异株为HK.3,占比47%,JN.1系列变异株占比42%;2024年第二季度主要流行变异株为JN.1系列,占比83%;2024年第三季度主要流行变异株为XDV.1,占比55%,JN.1系列占比24%.基因组变异分析显示:JN.1变异株相较其上一代变异株BA.2.86在刺突蛋白受体结合结构域(RBD)上出现了L455S氨基酸变异.XDV.1变异株是奥密克戎(Omicron)亚系中的一个多重组变异株,相较JN.1变异株,在刺突蛋白RBD上出现了F456L氨基酸变异.结论 2023年10月～2024年9月,秦皇岛市主要流行株为Omicron HK.3变异株、JN.1系列变异株和XDV.1变异株.在刺突蛋白RBD上,JN.1系列变异株和XDV.1变异株分别出现了特有的氨基酸变异:L455S和F456L.
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DOI
10.3969/j.issn.1671-7414.2026.01.029
发布时间
2026-01-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
秦皇岛市科技支撑计划项目（202301A055）
北大-默沙东传染病防控技术联合实验室医学创新基金（PM202506）
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