基于TCGA数据库对多种肿瘤HMGA1基因表达与诊断及预后相关性分析
Analysis of HMGA1 Gene Expression and Its Correlation with Diagnosis and Prognosis in Multiple Cancers Based on TCGA Database
摘要目的 探讨高迁移率族蛋白A1(HMGA1)在多种癌症中的潜在意义.方法 利用癌症基因组图谱(TCGA)、GE-PIA2、cBioPortal和GSCA数据库,运用Wilcox检验评估HMGA1在癌组织与癌旁组织中的表达差异;采用单因素COX分析和Kaplan-Meier方法进行生存分析;通过Spearman相关性检验,探讨HMGA1表达与免疫浸润细胞、肿瘤突变负荷(TMB)和微卫星不稳定性(MSI)之间的关联.结果 HMGA1在多种癌症中表现出显著的上调,并与预后相关.相关性分析揭示了HMGA1与免疫微环境、TMB和MSI之间的关系.通过基因集富集分析(GSEA),阐明了HMGA1在细胞因子和趋化因子信号传导、细胞周期调控以及抗原加工和呈递中的作用.HMGA1与TGX221、CCT007093等药物敏感度存在关联.结论 HMGA1可能成为泛癌诊断和预后的生物标志物.
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