基于TCGA数据库生物学信息分析FEN1与肺腺癌相关性并敲低FEN1基因抑制小鼠Lewis肺癌细胞生长及其分子机制的实验研究
TCGA-Based Analysis of FEN1 in Lung Adenocarcinoma and the Molecular Mechanism of FEN1 Knockdown Inhibiting the Growth of Lewis Lung Cancer Cells in Mice
摘要目的 基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库分析瓣状核酸内切酶1(FEN1)在肺腺癌(LUAD)中的表达及预后价值,并阐明其调控LUAD细胞生物学行为的分子机制.方法 分析TCGA数据库598例样本(539例LUAD组织、59例正常组织)转录组数据,评估FEN1表达与患者预后关系.构建FEN1敲低的小鼠Lewis肺癌细胞(LLC),按转染情况分为LLC组、shRNA-NC组和FEN1-shRNA组.采用细胞计数试剂盒-8(CCK8)法、流式细胞术(FCM)、Transwell法分别检测细胞增殖、凋亡、周期及迁移、侵袭能力.实时荧光定量PCR(RT-qPCR)和蛋白印迹(Western blot)检测上皮-间充质转化(EMT)标志物[上皮型钙黏蛋白(E-cadherin)、神经型钙黏蛋白(N-cadherin)、波形蛋白(Vimentin)]及细胞周期蛋白(Cyclin)D1、B细胞淋巴瘤/白血病-2基因(Bcl-2)、基质金属蛋白酶-9(MMP-9)的表达.结果 FEN1在LUAD组织中高表达,与不良预后显著相关(Log-rank检验,Z=2.81,P=0.005).成功构建FEN1稳定敲低细胞株,敲低效率83.8%.与LLC组相比,FEN1-shRNA组24、48h存活率降低(62.31%±2.84%vs 100%±0.93%、81.58%±2.35%vs 100.00%±4.88%),凋亡率增高(25.82%±0.30%vs 3.19%±0.46%),差异具有统计学意义(t=30.892、8.336、-70.889,均P<0.001);细胞周期阻滞于S期,S期比例升高(71.07%±3.27%vs 47.85%±4.15%),差异具有统计学意义(F=43.688,P<0.001).迁移细胞数(118.556±12.738 vs 192.222±14.986)、侵袭细胞数(92.667±3.000 vs 129.000±9.042)均显著降低,差异具有统计学意义(t=6.487、6.606,均P<0.01).分子机制显示,FEN1 敲低逆转EMT进程:E-cadherin蛋白和mRNA上调(t=-10.478、-4.235),N-cadherin、Vimen-tin、Cyclin D1、Bcl-2、MMP-9 mRNA和蛋白均下调(t=-20.825~33.396),差异具有统计学意义(均P<0.05).结论 FEN1在LUAD中高表达且与不良预后相关,通过调控EMT通路促进LUAD细胞恶性表型.FEN1敲低抑制细胞增殖、迁移侵袭并促进凋亡,可作为LUAD预后评估的生物学标志物和潜在治疗靶点.
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