基于脂质代谢相关基因的食管鳞癌预后预测模型构建及体外细胞实验验证

Construction of prognostic prediction model for esophageal squamous carcinoma based on lipid metabolism-related genes and validation in vitro cell experiment

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摘要目的:建立脂质代谢相关食管鳞癌(ESCC)预后预测模型,并通过体外细胞实验进行验证.方法:利用差异分析和Lasso-Cox回归分析筛选ESCC脂质代谢相关基因并构建预后预测模型,利用Kaplan-Meier曲线、单多因素Cox回归分析、受试者工作特征(ROC)曲线及临床病例特征分析风险评分的独立预后预测能力,通过体外实验验证PTPDC1在ESCC细胞中的表达和功能.结果:共筛选出4个与ESCC患者预后显著相关的脂代谢基因,可作为分子标签将ESCC患者分为高、低风险组.Kaplan-Meier曲线分析结果显示,低风险组患者总生存期(OS)显著优于高风险组(P＜0.001).单多因素Cox回归分析显示,由4个脂质代谢相关基因构成的风险评分可作为ESCC患者预后预测的独立因素.ROC曲线分析显示,脂质代谢风险评分的预后预测效能最佳.实时荧光定量PCR(RT-qPCR)结果显示,与人正常食管HET-1a细胞比较,PTPDC1在ESCC细胞系ECA109和KYSE150中的表达水平显著升高(均P＜0.05).敲降PTPDC1后,si-1-PTPDC1组和si-2-PTPDC1组PTPDC1相对表达量明显低于NC组(均P＜0.05);与NC组比较,ECA109和KYSE150细胞增殖和迁移能力显著降低(均P＜0.05).结论:基于4个脂质代谢基因构建的预后预测模型具有较好的预后预测价值,可以辅助ESCC患者进行个体化治疗.