换一批基于高通量测序的激素性股骨头坏死关键基因的筛选与分析
Screening and analysis of key genes for steroid-induced osteonecrosis of the femoral head based on high-throughput sequencing
摘要目的 探索激素性股骨头坏死(SONFH)基因表达上的差异,筛选出关键致病基因,为SONFH诊疗提供新的靶点.方法 选取我院 2020 年 12 月至 2021 年 6 月SONFH患者和股骨颈骨折患者 18例作为研究对象,SONFH患者设为SONFH组(6 例),股骨颈骨折患者设为对照组(12 例),通过高通量测序筛选出 2 组患者骨组织中差异表达基因(DEGs)以及差异MicroRNAs(miRNAs),利用R软件Clusterprofiler包对DEGs进行富集分析.结合P值选取前 30 位DEGs进行文献调研,筛选关键致病基因,并通过实时荧光定量聚合酶联反应(qRT-PCR)验证其表达.使用MirSNPInTarget、miRWalk和miRDB数据库预测关键致病基因靶向的miRNAs.结果 共得到 735 个DEGs(482 个上调,253 个下调)和 111 个差异miRNAs(34 个上调,77 个下调).P值较低的前 30 位DEGs中,HMOX1 在SONFH组中呈下调表达.qRT-PCR结果显示HMOX1在SONFH组表达低于对照组,差异有统计学意义(P<0.05).HMOX1 靶向的 2 个关键miRNAs为hsa-miR-21-5p、hsa-miR-148a-3p.结论 HMOX1 可能成为SONFH潜在的关键致病基因之一,参与了SONFH的发生与发展,为SONFH诊疗提供新靶点.
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关键词
股骨头坏死,激素性差异表达基因微RNAs血红素加氧酶1Osteonecrosis of the femoral head,steroid-inducedDifferentially expressedGenesMicroR-NAsHeme oxygenase 1
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.0253-9926.2023.13.001
发布时间
2023-09-25
基金项目
陕西省科学技术厅自然科学青年基础项目（2020JQ-964）
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