换一批
换一批基质金属蛋白酶1在头颈部鳞癌中的表达水平及微RNA调节的生物信息学研究
Bioinformatics study on expression level of MMP1 and microRNA regulation in head and neck squamous cell carcinoma
摘要目的 分析头颈部鳞癌(含皮肤鳞癌)中基质金属蛋白酶1(MMP1)和微RNA(miRNA)表达水平并筛选目标miRNA.方法 下载GEO相关数据,比较头颈部鳞癌MMP1表达水平.利用miRanda、TargetScan7.2和miRDB软件在线预测miRNA,进一步与miRTarBase结果做比对,获得目标miRNA并进行验证.分析目标miRNA与MMP1的相互关系.结果 与正常组织或不典型增生病变相比,MMP1在头颈部鳞癌(含皮肤鳞癌)组织中高表达,MMP1可参与癌变整个发展过程,并促进HNSCC转移;在线预测共获得3个目标miRNAs:miR-202、miR-326和miR-488,其中miR-202 mirSVR评分最高.相反,与正常组织相比,miR-202头颈部鳞癌(含皮肤鳞癌)中,miR-202表达水平明显低于正常组织,从正常皮肤-KIN1/2-KIN3-cSCC,miR-202可参与疾病整个发展过程.相关分析显示miR-202表达与MMP1呈负相关(r=-0.14,P＜0.05).结论 MMP1在头颈部鳞癌(含皮肤鳞癌)组织中高表达,miR-202低表达,miR-202可能是调节MMP1的真实miRNA,二者呈负相关.
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关键词
基质金属蛋白酶1微RNAs头颈鳞癌皮肤肿瘤计算生物学Matrix metalloproteinase 1MicroRNAsSquamous cell carcinomas of head and neckSkin neoplasmsComputational biology
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.0253-9926.2023.14.001
发布时间
2023-10-07
基金项目
天津市北辰区科技计划项目（SHGY-2020040）
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