换一批原癌基因Bmi-1 B细胞抗原表位及HLAⅠ类限制性CTL表位的生物信息学分析
Prediction of B cell epitopes and HLA Ⅰ restricted CTL epitopes derived from proto-onco-gene Bmi-1
摘要目的:预测原癌基因Bmi-1(B-cell-specific Moloney murine leukemia virus insertion site 1)的B细胞抗原表位及HLA I类限制性细胞毒性T细胞(cytotoxic T cell)表位.方法:采用Ellipro(http://tools.immu-neepitope.org/ellipro/)预测Bmi-1蛋白中可能存在的线性B细胞表位和构象B细胞表位;采用ProtParam、NetCTL等软件和方法预测Bmi-1中可能存在的HLA I类限制性CTL表位.结果:Bmi-1蛋白中含有6个线性B细胞表位和8个构象B细胞表位;结合HLA结合力、蛋白酶体切割效率和TAP转运效率,经过NetCTL程序预测表明:针对不同的HLA I类分子,原癌基因Bmi-1中都存在多个HLA I类分子的限制性CTL表位.结论:综合运用多个程序预测了原癌基因Bmi-1中的B细胞抗原表位及HLA I类分子的限制性CTL表位,为下一步开展针对Bmi-1的免疫靶向治疗等研究打下了基础.
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DOI
10.3969/j.issn.1672-4992.2018.09.004
发布时间
2018-06-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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