换一批基于TCGA数据库挖掘UBE2C在肾透明细胞癌中的表达及预后意义
The expression and prognostic significance of UBE2C in KIRC utilizing TCGA datasets
摘要目的:通过研究泛素偶联酶E2C(ubiquitin-conjugating enzyme E2C,UBE2C)在肾透明细胞癌(kid-ney renal clear cell carcinoma,KIRC)组织中的表达,阐明其对KIRC早期诊断及预后的影响.方法:利用Onco-mine、GEPIA数据库和人类蛋白质表达图谱(The Human Protein Atlas,HPA)分析UBE2C在KIRC组织中mR-NA和蛋白质水平的变化.运用LinkedOmics和GEPIA数据库阐述UBE2C表达与KIRC临床病理学参数的相关性及对预后的影响.在String-DB数据库中探索UBE2C基因在细胞信号转导通路中的位置以及与其关系密切的上下游基因.结果:UBE2C的mRNA在KIRC中表达增加,并且与KIRC病理分级、TNM分期呈正相关,且与种族和人种相关(P＜0.05).我们应用TCGA分析的结果显示:高水平UBE2C是KIRC总生存率和无病生存率不良的独立预后因素(P＜0.01).IHC结果证实,与正常肾组织相比,KIRC中UBE2C的蛋白表达量显著升高(P＜0.05).与UBE2C相关的蛋白有ANAPC10、ANAPC11、ANAPC2、ANAPC4、ANAPC5、AUR-KA、AURKB、CCNB1等,可能参与细胞周期检查点及蛋白泛素化等细胞功能.结论:通过TCGA数据库信息挖掘发现,UBE2C在KIRC组织中呈高表达,且与患者生存期有关,将为后续的肾癌研究提供重要的理论依据.
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关键词
UBE2C肾透明细胞癌数据库分析诊断预后UBE2Ckidney renal clear cell carcinoma(KIRC)database analysisdiagnosisprognosis
分类号
R737.11（泌尿生殖器肿瘤）
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1672-4992.2018.24.004
发布时间
2018-12-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家自然科学基金（81702631）
西安交通大学第一附属医院基金（2017QN-14）
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