子宫内膜癌ceRNA的构建及LINC-FAM138B对HEC1B细胞恶性生物学行为的影响
Construction of endometrial carcinoma ceRNA and the effect of LINC-FAM138B on the malignant biological behavior of HEC1B cells
摘要目的:构建子宫内膜癌(endometrial carcinoma,EC)竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)并研究LINC-FAM138B对HEC1B细胞恶性生物学行为的影响.方法:从TCGA数据库下载EC患者的表达谱,筛选差异基因并构建ceRNA网络.STRING结合Cytoscape进行蛋白互作分析及筛选Top10基因,筛选与预后相关的基因,RT-qPCR实验验证LINC-FAM138B、hsa-mir-429 和PRKG1 在EC患者的癌组织及癌旁组织样本(n =7)中的表达水平.将细胞分为OV LINC-FAM138B组、Sh LINC-FAM138B组、OV NC组和Sh NC组,通过CCK-8 实验检测细胞增殖能力;划痕实验检测细胞迁移能力;Transwell实验检测细胞侵袭能力;流式细胞术检测细胞凋亡能力.结果:筛选到 457、65 和 1 119 个差异lncRNA、miRNA和mRNA.获得具有 823 个调控关系对的 ceRNA 网络.结合 Top10 基因和生存分析结果发现PRKG1 是LINC-FAM138B结合 hsa-mir-429 靶向基因中得分最高的基因.PRKG1、RBFOX3、RGS2、SLC2A4 高表达的EC患者预后显著比低表达的患者差(P<0.05).RT-qPCR实验结果表明,与癌旁组织相比,LINC-FAM138B和PRKG1 在EC癌组织中低表达(P<0.05),而hsa-mir-429 在EC癌组织中高表达(P<0.05).与OV NC组比较,OV LINC-FAM138B组中HEC1B细胞的增殖、迁移、侵袭能力显著下降(P<0.05),凋亡能力显著上升(P<0.01).与Sh NC组比较,Sh LINC-FAM138B组中HEC1B细胞的增殖、迁移、侵袭能力显著上升(P<0.01),凋亡能力显著下降(P<0.05).结论:构建了EC的ceRNA网络,且发现LINC-FAM138B抑制HEC1B细胞的增殖、迁移和侵袭及促进细胞的凋亡.
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