基于多重生物信息学数据库分析Mis18β在膀胱癌组织中的表达及其临床意义
Expression of Mis18β in bladder cancer tissues and its clinical significance based on multiplex bioinformatics database
摘要目的:探讨Mis18β基因在膀胱癌组织中的表达、临床意义及在疾病过程中的作用.方法:通过癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库获得膀胱癌患者Mis18β mRNA测序数据及临床资料数据,通过基因表达综合(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库获得膀胱癌Mis18β表达数据,分析Mis18β在膀胱癌组织和癌旁组织中mRNA表达差异及与患者临床病理参数的相关性并进行生存分析,利用基因本体论(Gene Ontology,GO)功能分析以及京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Gene and Genomes,KEGG)通路富集分析探索Mis18β在膀胱癌发生发展中可能的信号通路.收集膀胱癌患者及健康对照者外周血标本,RT-PCR方法验证Mis18β mRNA表达水平的差异.结果:TCGA数据库和GEO数据库分析显示膀胱癌组Mis18β的表达量明显高于对照组(P<0.05).生存分析提示Mis18β高表达组膀胱癌患者的总生存期明显低于低表达组(P<0.05).功能富集分析显示Mis18β主要参与细胞有丝分裂,调控细胞周期及DNA复制等过程.膀胱癌患者外周血有核细胞中Mis18β的含量明显高于对照组(P<0.05).结论:Mis18β在膀胱癌中呈高表达,其表达水平与患者年龄、病理类型、总生存期等临床病理特征存在相关性,为揭示膀胱癌发生发展的分子机制及寻找新的诊断、预后标志物提供了理论基础.
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