换一批
换一批摘要目的 通过构建lncRNA-miRNA-mRNA调控网络揭示骨关节炎的关键基因,并预测其潜在治疗药物.方法 从基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库获取骨关节炎(Osteoarthritis,OA)和正常骨关节样品差异表达的lncRNA和mRNA,并通过miRDB、miRTarBase、TargetScan数据库预测miRNA,并整合lncRNA-miRNA与miRNA-mRNA表达谱的相互作用,以构建ceRNA网络.将miRNA预测靶基因与差异表达mRNA取交集,构建PPI网络图,并进行GO功能和KEGG通路富集分析.利用Coremine Medical数据库筛选核心靶点预测得到的中药.结果 共鉴定出339个DEmRNA和476个lncRNA.在ceRNA网络中总共获得了 4个差异的lncRNA-miRNA相互作用和39个失调的miRNA-mRNA相互作用,包括4个DElncRNA,20个miRNA和39个DEmRNA.PPI网络图鉴定出VEGFA、DDIT4、MMP2、SESN1、VCAN等10个靶点可能是调控骨关节炎的核心靶点.随后的富集分析表明,这些mRNA在OA的发展过程中调节了生物代谢、细胞外基质的组织和免疫反应等生物过程,并丰富了 HIF-1信号通路和PI3K-Akt信号通路.预测得到丹参、郁金、姜黄、黄芪、白花蛇舌草等中药可能是治疗OA的潜在药物.结论 这项研究为OA中与lncRNA相关的ceRNA网络提供了新颖的见解,丹参、郁金、姜黄、白花蛇舌草可能是治疗OA潜在药物.
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