不同乳腺癌细胞株胞外囊泡特性和差异miRNA自噬通路靶基因分析
EVs Characteristics and Differential miRNA Autophagy Pathway Target Genes in Different Breast Cancer Cell Lines
摘要目的 研究不同乳腺癌细胞株EVs特性和所含miRNA的数量和功能差异.方法 采用无血清培养基对正常乳腺上皮细胞HMEC和乳腺癌细胞株MDA-MB-231、MCF-7进行培养,通过纳米粒径分析对胞外囊泡颗粒大小和含量分布,利用投射电镜观察胞外囊泡形态,采用Western bolt检测胞外囊泡膜蛋白标记物CD63.通过转录组测序对胞外囊泡中miRNA进行差异分析,利用GO和KEGG分析差异miRNA靶基因.结果 通过多峰粒径分析显示,HMEC与MDA-MB-231、MCF-7胞外囊泡粒径分布、含量有所不同.三株细胞均可检测到具有典型特征胞外囊泡和标记物CD63的表达.HMEC、MCF-7、MDA-MB-231胞外囊泡中共有已知miRNA分别为613、333、698个.以HMEC为对照,进行差异比较分析发现,MCF-7的胞外囊泡中显著上调和下调的miRNA分别为108个和86个,MDA-MB-231的胞外囊泡中显著上调和下调的miRNA分别为135个和246个.GO和KEGG富集分析发现差异miRNA的靶基因涉及多种生物学功能,尤其细胞自噬.结论 不同乳腺癌细胞株胞外囊泡从直径、数量分布、所含miRNA都与正常乳腺上皮细胞存在差异,不同乳腺癌细胞株之间也存在差异.乳腺癌细胞株胞外囊泡的差异miRNA可能对其自身或作用的靶细胞的自噬水平产生不同影响,其机制有待进一步研究揭示.
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