应用16S rRNA基因测序比较分析不同品系1型糖尿病小鼠肠道菌群的异同
Use of 16S rRNA Sequencing for Comparative Analysis of Gut Microbiome in Different Strains of Type 1 Diabetic Mice
摘要目的 比较C57BL/6(B6)和FVB两个品系小鼠建立的 1 型糖尿病(T1DM)模型肠道菌群组成和多样性的异同,为探索两模型在 T1DM 相关肠道菌群研究中的进一步应用提供背景数据.方法 采用 8 周龄 SPF 级雄性 B6和 FVB小鼠各 20 只,两组小鼠每天腹腔注射 40 mg/kg 的链脲佐菌素(STZ)连续 5 d,小鼠空腹血糖连续 2 周≥11.1 mmol/L 为 T1DM 建模成功,建模 6 周后每组分别收集 10 份洁净粪便,进行 16S rRNA 基因 V3-V4 区测序,分析粪便中肠道菌群的 Alpha 多样性、Beta 多样性、优势菌科及肠道菌群相关的功能通路.结果 B6 与 FVB 组T1DM小鼠肠道菌群的 Alpha多样性和丰富度没有显著差异(P>0.05),两组小鼠的菌群 Beta多样性存在统计学上的差异(P<0.05).B6 组 T1DM 小鼠肠道的优势菌科为 Muribaculaceae、Lactobacillaceae、Lachnospiraceae、Prevotellaceae、Desulfovibrionaceae、Akkermansiaceae;FVB 组 T1DM 小 鼠 肠 道 的 优 势 菌 科 为 Lactobacillaceae、Muribaculaceae、Lachnospiraceae、Prevotellaceae、Clostridiales_unclassified、Saccharimonadaceae、Marinifilaceae;两组中共有的优势菌科在比例上差异很大.B6 与 FVB组的厚壁菌门与拟杆菌门的比值都显著增加.两组 T1DM 小鼠肠道菌群的功能通路集中在以氨基酸、糖代谢及核苷酸的代谢途径中.结论 两组 T1DM 小鼠肠道菌群 Alpha 多样性无差异,但肠道菌群的组成及比例差异较大,优势菌群在不同模型中的组成比例发生了改变.
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