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基于癌症基因组图谱数据库双硫死亡相关LncRNA构建肝细胞癌预后模型及其效能分析

Disulfidptosis-related LncRNA for constructing prognostic model of patients with hepatocellular carcinoma based on TCGA database

摘要目的 鉴定与双硫死亡相关长链非编码RNA(DRLs)相关的肝细胞癌(HCC)预后特征并构建预后模型.方法 从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中获取HCC数据,基于单因素COX回归、套索回归(LASSO)和多因素COX回归筛选DRLs,构建HCC预后模型并验证模型效能.基于风险评分中位值划分HCC高风险组与低风险组.基于DRLs特征,通过聚类分析识别HCC分子亚型.基于不同的风险分组和分子亚型聚类进行生存分析.结果 共鉴定出3002个DRLs,经单因素COX回归筛选得到345个与预后相关的DRLs(P<0.05);LASSO回归进一步将DRLs数量筛选至7个,最后经多因素COX回归筛选获得3个参与模型构建的DRLs;风险评分公式如下:风险评分=0.9478×AC026412.3表达量+0.5511×RNF216P1表达量+0.5367×TMCC1-AS1表达量;高风险组总生存期(OS)显著低于低风险组(P<0.05);聚类分析将HCC样本分为3个分子亚型,即聚类1(C1)、聚类2(C2)和聚类3(C3);生存分析显示C2类HCC患者预后最好,C1次之,C3最差(P<0.001).结论 应用3个DRLs构建的HCC预后模型可为患者的个性化管理及治疗提供指导依据.

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