基于生物信息学分析E2F1在头颈鳞癌中的表达及临床意义
Expression and significance of E2F1 in head and neck squamous cell carcinoma based on bioinformatics analysis
摘要目的:探讨转录因子E2F1在头颈鳞状细胞癌(HNSC)组织中的表达、临床意义及预后相关性.方法:基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库,分析E2F1在HNSC中的转录水平及其与HNSC患者生存率的关系和对HNSC的诊断价值.通过UALCAN数据库和GEPIA数据库分析E2F1在HNSC中表达水平及其与临床病理参数的相关性.通过CBioportal数据库分析E2F1的相关基因,进行KEGG通路富集分析及GO功能富集分析.纳入口腔鳞状细胞癌(OSCC)患者44例和正常口腔黏膜对照21例,免疫组织化学法(IHC)及RT-PCR法检测E2F1蛋白水平及mRNA水平的表达及其mRNA与临床病理的相关性.结果:TCGA数据显示,E2F1在癌组织中表达显著高于正常组织(P<0.01),与IHC及PCR检测结果一致(均P<0.01).受试者工作特征曲线(ROC),显示曲线下面积(AUC)为0.966,在HNSC患者中E2F1的表达与预后呈正相关(P<0.05).PCR结果显示,E2F1 mRNA在OSCC中呈高表达(P<0.01),不同分化程度(P<0.01),临床分期(P<0.05),有无淋巴结转移(P<0.05)具有统计学意义.与TCGA数据库中分析结果一致.不同年龄、性别组间差异无统计学意义(P>0.05),与TCGA的数据分析结果不一致.KEGG通路富集及GO功能分析结果显示,E2F1及其相关基因的生物过程主要涉及错配修复,细胞周期,DNA复制等过程.结论:E2F1的高表达可能与OSCC的发生、发展、转移密切相关.
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