换一批多因子降维法分析基因与环境因素交互作用的研究
Study on Interaction Between Gene and Environment Factor by Using Multifactor Dimensionality Reduction
摘要目的 探讨多因子降维法(multifactor dimensionality reduction,MDR)在筛选糖尿病的基因与环境危险因素交互作用时的用法以及MDR的优缺点,并与传统的Logistic回归做比较.方法 通过模拟研究确定MDR所适用的样本量大小,实例分析采用针对糖尿病的病例对照研究数据,分别用MDR方法、Logistic回归进行分析,将两种结果进行对比进而对两种方法作出评价.结果 模拟实验结果表明MDR在分析1阶交互作用时效能不如Logistic回归,但随着样本量的增大,两种检测方法效能趋于一致；在分析高阶交互作用时,MDR所表现出的效能高于Logistic回归,而且在分析2阶交互作用中,样本量200时MDR已经表现良好,当样本量为300时,MDR显示了微弱的优势.实例分析中MDR的最优模型为174G/C和是否总胆固醇和总甘油三酯同时偏高之间的交互作用,预测准确率为0.5822,交叉验证一致性为8/10,置换检验有统计学意义(P=0.021).结论 MDR在分析小样本、高维度数据中表现良好,可有效的分析糖尿病基因与环境的交互作用.
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医学主题词
多因子降维法(Multifactor Dimensionality Reduction)糖尿病(Diabetes Mellitus)基因(Genes)环境(Environment)研究(Research)
分类号
R363.1（病理学）
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1006-3110.2011.11.003
发布时间
2012-03-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
黑龙江省自然科学基金项目（(D2007-16)）
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