换一批摘要目的 以WTCCC工期公开发表的高血压SNPs数据作为实际数据,展开基于MAX的生物学通路分析,完成该方法的实现过程,并探讨其优势. 方法 运用Python语言和PLINK软件对数据进行格式转换,应用MAX方法进行单个SNP位点的关联分析,通过i-GSEA4GWAS网络分析平台进行通路分析,寻找疾病的差异表达生物学通路.结果 共筛选出6条差异表达通路,查阅文献发现2条差异表达通路与高血压有直接关系,2条差异表达通路与高血压有间接关系. 结论 在疾病的遗传模型未知的情况下,基于MAX的生物学通路分析综合考虑了多个遗传模型的信息,是一种高效且稳健的分析方法.
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关键词
单核苷酸多态性通路MAX方法i-GSEA4GWAS网络分析平台Single nucleotide polymorphismPathwayMAXi-GSEA4GWAS network analysis platform
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DOI
10.3969/j.issn.1006-3110.2014.01.002
发布时间
2014-03-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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