换一批2010-2013年中山市流感病毒(H3N2)血凝素基因特征分析
Analysis on the genetic characteristics of influenza A (H3N2) virus hemmagglutinin (HA) in Zhongshan City in 2010-2013
摘要目的 研究中山市2010-2013年流行的H3N2亚型流感病毒的血凝素基因特征,分析其基因变异情况. 方法 选取2010-2013年中山市流行的H3N2亚型流感病毒6株,用MDCK细胞分离病毒,提取病毒RNA,RT-PCR扩增HA基因并测定序列,利用BLASTn对序列进行相似性检索,分析其与疫苗株,不同年份、区域流行株的进化变异情况.结果 共分离鉴定到6株H3N2亚型流感病毒,其中2株为2010年流行株,2株为2012年流行株,2株为2013年流行株.各年流行株与其他国家或地区当年大部分流行株在一个分支上,其进化距离随着进化时间变长而变远.2012年流行株相对2010年流行株在HA1区发生12个氨基酸位点变异,有3个位于B、C区.2013年流行株相对2012年流行株发生4个氨基酸位点变异,有2个位于A区.2012年、2013年流行株相对于疫苗株分别发生6、8个氨基酸位点变异,分别有2、4个位于A、B、C区.受体结合位点未发生变异. 结论 中山市H3N2亚型流感病毒流行株在年度之间存在一定程度变异,进化距离随着进化时间变长而变远,相对于疫苗株也存在一定程度上的变异.
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关键词
H3N2亚型流感病毒血凝素基因基因变异进化疫苗株Influenza A(H3N2) virusHemagglutinin geneGenetic variationEvolutionVaccine strain
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1006-3110.2015.04.010
发布时间
2015-05-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
中山市卫生局医学科研立项课题（(J2012144)）
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