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惩罚logistic回归方法在SNPs数据变量筛选研究中的应用

Application of penalized logistic regression methods to the variable selection of SNPs data

摘要目的 比较L1正则化、L2正则化和弹性网三种惩罚logistic回归对SNPs数据的变量筛选能力. 方法 根据所设置的参数生成不同条件的SNPs仿真数据,利用正确率、错误率和正确指数从三个方面评价三种惩罚logistic回归的变量筛选能力. 结果 正确率表现为L2正则化惩罚logistic回归>弹性网惩罚logistic回归>L1正则化惩罚logistic回归;错误率表现为L2正则化惩罚logistic回归>弹性网惩罚logistic回归>L1正则化惩罚logistic回归;正确指数则表现为弹性网惩罚logistic回归>L1正则化惩罚logistic回归>L2正则化惩罚logistic回归. 结论 综合来看弹性网的筛选能力更优,弹性网融合L1、L2两种正则化的思想,在高维数据分析中既能保证模型的稀疏性,便于结果的解释,又解决了具有相关性自变量不能同时进入模型的问题.

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实用预防医学

实用预防医学

2016年23卷11期

1395-1399页

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